Події фільму «Знаки» переносять глядачів у штат Пенсільванія, де розташувалася ферма колишнього священика Грехема Хесса - вдівця, який залишив сан після загибелі дружини і поодинці виховує двох дітей. На полях героя, засіяних кукурудзою, щось або хтось залишає ідеальні кола. Походження цих об'єктів невідоме, але на додаток до них починають відбуватися і інші дивні речі. Поліція безсила, тим більше, що весь світ охоплений подібними явищами. Люди бачать вогні в небі, а деяким вдається навіть закарбувати перший контакт з прибульцями. Очевидно одне: більш розвинені в технологічному плані гості завітали не з миром. Оскільки на планеті панує паніка, сподіватися на допомогу не доводиться. Грехем з дітьми і молодшим братом готується оборонятися, забиваючи вікна в будинку і облаштовуючись в підвалі. Людство може вціліти, якщо знайде слабке місце інопланетян або зрозуміє причини їх експансії. Сім'я Хесс виявляється в числі тих, хто приймає перший удар і саме у них є шанс знайти відповіді.